Em Mega Man X5, o mal Sigma tenha desviado um asteróide colônia para rota de colisão com a Terra, e Mega Man X e seu parceiro robô Zero têm apenas 48 horas para interceptar e prevenir a total aniquilação! Batalha perigoso Reploid uma legião de robôs, descobrir uma miríade de power-ups e derrotar um exército de mutantes chefes. Roubar a sua energia todas as forças e criar novas armas ... Terra depende dele!

Novo no Mega Man X5! escolher como quer jogar o Mega Man X ou zero no início de cada estádio, tempo de base jogabilidade. Seu jogo cada movimento determina eventos e terminações; derrota vicioso patrões para obter itens que se combinam para criar novas armas e peças.